Flekkgrisøre er en lav til høy, stivhårete, flerårig kurvplante. Stenglene er enkle eller noe grenete og tykkere oppunder kurvene. Bladene er elliptiske til ovale, hårete og som oftest helrandete med spredt tannet bølgekant og har purpurfargede mørke flekker, noe som er karakteristisk for denne arten.


Planten blomstrer i juni-juli med sitrongule blomster samlet i 3-5 cm brede blomsterkurver. Kurvdekkbladene er lansettformede, dypt mørkegrønne og ruhårete. Frukten har fjærfnokk.

Flekkgrisøre vokser på tørre gressbakker, beitemark, flatberg, berghyller i blomsterenger, åpen skog og veikanter. Planten finnes i Sør-Norge og så langt nord som til Trøndelag.