Flekkmarihånd er en nokså høyvokst, flerårig plante. Orkidéen kan bli opptil 60 cm høy. Bladene er støttannliknende og har mørke flekker.
Blomstringen foregår i juni-august. Blomstene er blekrosa, purpur eller hvitaktige og sitter ordnet i en knoll. Leppen (7-9 mm) har mørkere flekker og krøllinjer.
Flekkmarihånd er en variabel art og forekommer med et par underarter her til lands. På kalkfattig grunn dominerer hovedunderarten flekkmarihånd (ssp. maculata). I rikere og mer kalkrikt jordsmonn finner vi underarten skogmarihånd (ssp. fuchsii).
Begge disse underartene kan hybridisere med andre arter i marihandslekten, som f.eks. engmarihånd (D. incarnata) og smalmarihånd (D. trausteineri). Dette gjør artsbestemmelse til en litt innviklet affære.
Flekkmårihand er vanlig i hele Norge bortsett fra på Svalbard, og vokser på myrer, fuktige enger og skogbunn med sur jord (barskoger).
